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En gros : tu incarnes le chef de la Delta force, une unité de soldat américaine, qui est à Dubai, complétement ravagée par les tempêtes de sable, pour une mission de reconnaissance et de sauvetage, car un message radio d'un certain colonel Konrad a été intercepté. Tu dois donc à la base lui porter secours, à lui et à son escouade, le 33ème régiment de l'armée américaine. Konrad est d'ailleurs un de tes anciens compagnons d'armes, on apprend au début du jeu que tu as fais une mission avec lui à Kaboul, lors de la guerre d'Afghanistan. Toi et ton équipe ne savent pas ce qu'il passe pendant une bonne partie du temps, et découvre les évènements au fur et à mesure. Tu découvres que le 33ème régiment s'est rebellé, et tu vas te battre contre eux. Tu vas t'allier avec la CIA pour comprendre ce qu'il se passe. Tu découvres ensuite que Konrad est en réalité le grand méchant, et qu'il est à l'origine de la rébellion du 33ème régiment, de la guerre civile avec les insurgés et des massacres à l'arme chimique. Toi et ton équipe allez tout faire pour venger ses crimes et le tuer, par tous les moyens. Pour arriver à ce but, tu vas commettre d’innommables massacres et crimes (phosphore blanc contre les civils, vol des réserves d'eau, massacre sur la population... Le héros que tu incarnes sombre peu à peu dans la folie en essayant de se convaincre qu'il n'est pas responsable de tout ça, mais qu'il a été contraint de le faire c'est Konrad est le vrai responsable. Sauf qu'à la fin, tu découvres que Konrad est mort depuis bien longtemps, et que tu es le seul responsable de toutes ces atrocités, alors que tu n'étais venu à la base que pour aider les populations et les survivants à quitter Dubai en état de siège. A la fin, tu as le choix entre te suicider (te laisser tuer par le faux Konrad dans ton esprit) ou alors assumer tes actes (tuer le Konrad dans ton esprit).
