Attention SPOIL des deux jeux :
Une sorte d'IA hyper évoluée qui se trouvait sur la même planète que les Zenith Lointain a pris en chasse ces derniers et a décidé de détruire toute vie sur Terre car c'était la destination des Zenith Lointain durant leur fuite de cette IA appelée Nemesis.
Afin que Nemesis détruise la vie sur Terre, celui-ci a émis un signal à l'attention de la fonction subordonnée Hadès sur Terre. Ce signal l'a rendu autonome et incontrôlable lançant le processus de destruction de la vie.
Afin de contrer sa sous entité belliqueuse, car la terraformation se passait bien, Gaïa s'est auto détruite ça a eu pour effet d'isoler Hadès et de l'empêcher d'utiliser ses capacité d'inversion de la Terraformation rendant toutes les autres fonctions subordonnées autonomes, et complètement en roue libre, y compris Héphaïstos, l'entité chargée des machines actuelles.
Sans Gaïa pour contrôler, les fonctions subordonnées, les machines d'Héphaïstos ne se contentent plus que de faire le travail de terraformation, cette entité estime que la chasse des humains envers les machines ne doit pas rester impunie.
C'est le début du Dysfonctionnement.
C'est alors que les machines actuelles peuvent être divisées en deux groupes, celles qui à l'origine avaient une fonction qui aide à la terraformation et qui n'a jamais été crée pour être agressive comme les Galopeur, les Cornes-Filantes ou encore les Charognardes.
L'autre groupe ce sont les machines spécifiquement conçu pour tuer des humains comme le Dent de Scie, le Ravageur, le Traqueur ou le Gueule d'Orage.
Tous les deux ans depuis le début du Dysfonctionnement, une nouvelle machine tueuse apparait en sortant des creusets.
